بتائین می تواند به عنوان افزودنی خوراک برای بهبود سلامت روده استفاده شود. عوامل نامطلوب مانند استرس گرمایی می تواند منجر به کشش ضعیف روده در حیوانات شود. هنگامی که دمای محیط افزایش می یابد، خون ترجیحاً به سمت پوست جریان می یابد تا گرما را تسهیل کند. این منجر به کاهش جریان خون در دستگاه گوارش می شود که به نوبه خود بر هضم تأثیر می گذارد و قابلیت هضم مواد مغذی را کاهش می دهد.

استرس می تواند باعث تغییر در ساختار روده خوک های در حال رشد شود، اگر کنترل بیشتری وجود نداشته باشد، عملکرد روده را کاهش می دهد. بتائین اثرات مفیدی بر ساختار روده و سیستم ایمنی حیوانات دارد. اثر مفید آن در حفظ یکپارچگی مجرای روده حیوان، می تواند حیوان را از کم آبی ناشی از کوکسیدیوز یا تکثیر سایر میکروارگانیسم های نامطلوب در دستگاه روده محافظت کند.

تحقیقات نشان می دهد که استفاده ترکیبی از داروهای ضد کوکسیدیال بتائین و یونوفور می تواند به طور قابل توجهی خطر ابتلا به عفونت کوکسیدیا را در حیوانات کاهش دهد و سپس عملکرد رشد و مقاومت آنها را بهبود بخشد. مخصوصاً برای خوکچه ها، افزودن بتائین در خوراک آنها می تواند عملکرد روده را بهبود بخشد و از اسهال جلوگیری کند و مصرف خوراک را افزایش دهد که ارزش عملی فوق العاده ای دارد. علاوه بر این، افزودن بتائین در خوراک می‌تواند پاسخ استرس خوک‌ها را کاهش داده و سپس مصرف خوراک و سرعت رشد خوک‌های از شیر گرفته را بهبود بخشد.